Село Кара-Коо находится в Тонском районе Иссык-Кульской области.
Согласно местным преданиям, название села связано с глубоким оврагом. На северо-западной стороне села располагался глубокий овраг протяженностью 2-2,5 км, поэтому село назвали Кара-Коо. До 1930 года в данной местности проживали первые переселенцы. В 1930-1931 годах началось строительство одной из крупных дорог вокруг озера и в связи с этим местные жители переселились в местность, где сейчас располагается село.